Arzneimittel, die von der Industrie nicht angeboten werden, werden durch die Krankenhausapotheke selbst hergestellt. Hierzu zählen u.a. alle Arzneimittel, die patientenindividuell dosiert werden müssen, wie z. B. Medikamente für Kinder (pädiatrische Kleinstdosen) oder Medikamente zur Krebsbehandlung (Zytostatika). Allein die Zubereitung solcher Zytostatika umfasst ca. 20 000 applikationsfertiger Präparate.
Ein modernes Labor mit aufwändiger Sicherheitstechnik garantiert die bestmögliche Qualität dieser Zubereitungen.
Die Analytik von Ausgangsstoffen und Eigenprodukten auf Identität, Reinheit und Gehalt auf hohem Niveau sichert die pharmazeutische Qualität und Unbedenklichkeit.